El blog de danitxu

Y no estamos hablando de USA o de Japón sino de aquí mismo, porque en los Servicios Generales de Investigación de la UPV/EHU (SGIker), se encuentra el Servicio General de Informática aplicada a la Investigación (SGI), donde se ofrecen dos importantes recursos: Arina (ver figura) y Péndulo.

Conversamos con el Dr. Edu Ogando, responsable de los mismos junto con el Dr. Txema Mercero.

Cuéntanos brevemente para qué campos de investigación se usan Arina y Péndulo, y si en alguno de esos campos se emplean programas libres
En cálculo científico se emplea en prácticamente todas las áreas de conocimiento. En concreto los mayores usuarios de nuestras máquinas son químicos, pero también se usa en Física, Matemáticas, Biología, Ingeniería, Informáticos (en este caso para el estudio de lenguaje),…
En lo que respecta al software libre hay muchos investigadores que lo usan para llevar a cabo sus investigaciones, por ejemplo, se ha secuenciado parte del genoma del pez corcón básicamente usando Péndulo y el software mpiBLAST que es GPL.

Leo que estos dos servicios emplean unos 320 y 140 núcleos respectivamente, y además sé que Péndulo es innovador por la forma de usar los recursos
Comentar que estamos configurando la ampliación de Arina que incluye 440 cores más. En Péndulo tratamos de aprovechar los recursos de la UPV/EHU, aulas docentes, como cluster de investigación nocturno sin coste, por eso usamos versiones gratuitas de software libre.

Dentro del listado de software veo algunos programas de licencia libre (Octave, Scilab, Gromacs) y otros con privativa. Respecto al sistema operativo ¿puedes indicarnos cuáles se están usando y por qué, así como un precio aproximado de los servicios que ofrecen sus proveedores (por constatar que también en este campo existe negocio con software libre)?
Ahora mismo, hay OpenSuse y vamos a migrar a CentOS que está basada en Red Hat. En Arina tenemos Red Hat y sí pagamos soporte, aunque no te puedo dar cifras. Que hay negocio en este área yo creo que es indiscutible pues ahí llevan años, entre otras, empresas como Red Hat o Suse ofreciendo soluciones de calidad. Y ya se vio hace una semana en la última estadística de top500, que el 91% de los ordenadores para entornos de producción más cualificados usan Linux y solo un 1% Windows, el sistema operativo no libre más popular en entornos de escritorio.

Entendiendo que éstos son los mayores supercomputadores a nivel de Euskadi, ¿cómo nos situamos respecto a este tipo de infraestructuras en comparación con el resto del estado?
Yo diría que estamos a un nivel normal, no destacamos especialmente con otros centros que han conseguido cierta centralización de sus recursos de cálculo científico.

¿Ha habido alguna aportación al software libre desde vuestro servicio?
No. Somos usuarios y no programadores. Péndulo es un desarrollo propio pero no llega a distribución, sólo hemos desarrollado algunos scripts de configuración y utilidades; sí hemos aportado documentación pues el proyecto Péndulo está documentado en un proyecto de fin de carrera que hizo Rocío Carrillo.

Mila esker elkarrizketagatik. Hona hemen Edu Ogando doktorea eta bere eskuinean Arina klusterra, “el pensante y la calculadora“:

Esta entrada fue escrita el Jueves, 10 de junio de 2010 a las 0:30 y archivada en /home/bestebat. Puedes seguir cualquier respuesta a esta entrada a través del feed RSS 2.0. Puedes dejar una respuesta, o trackback desde tu propio sitio web.